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LAMP-MS for Locus-Specific Visual Quantification of DNA 5mC and RNA m6A Using Ultra-Low Input

2026-04-13 09:59 系统

论文题目:LAMP-MS for Locus-Specific Visual Quantification of DNA 5mC and RNA m6A Using Ultra-Low Input

期刊名称:ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION

成果所有人:胡璐璐

论文发表时间:202411

致谢平台或仪器:质谱平台

优秀案例分享:

复旦大学胡璐璐研究员团队与复旦大学华山医院消化科刘杰教授、美国芝加哥大学何川教授合作,设计了一种结合线性扩增与单碱基定量核酸质谱的新型技术(LAMP-MS)。该技术能够对低至1 ng的血浆cfDNA进行无偏倚扩增,实现多个cfDNA甲基化位点的高分辨率可视化检测。LAMP-MSCRC的早期筛查提供了一种经济高效且可视化的方法,具有降低CRC相关发病率和死亡率的巨大潜力。除此之外,研究团队还通过整合GLORI与质谱技术,实现了对RNA m6A修饰的定量检测,拓展了质谱技术在低起始量样本中RNA修饰检测的应用前景。此外,该研究还开发了基于GLORI技术的单碱基m6A可视化核酸质谱定量方法。与以往依赖放射性标记或偏重于定性检测的技术不同,这种新方法提供了一种经济高效且能够在单核苷酸分辨率下精确量化m6A位点的手段。值得注意的是,该技术不仅适用于m6A,还可广泛应用于其他RNA修饰,如m1Am5C和假尿苷(Ψ)等。该研究成果的发表,为临床早期癌症筛查和RNA修饰检测提供了新的技术手段,具有重要的应用价值和前景。相关文章于2024114日在线发表于ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITIONSCI一区, IF2024 = 16.1)杂志。

该研究通过复旦上医质谱平台检测了合成引物探针中DNA 5mC的含量(分别为0%5%10%25%50%75%100%),成功构建了5mC含量与质谱定量结果之间的校准曲线。