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论文题目:A Chemoproteomic Approach for System-Wide and Site-Specific Uncovering of Functional Protein N-Glycosylation
期刊名称:Journal of the American Chemical Society
成果所有人:陆豪杰课题组
论文发表时间:2025年06月26日
致谢平台或仪器:TIMS TOF Pro
优秀案例分享:
热蛋白质组学(TPP)技术将细胞热位移分析(CETSA)与多重定量质谱分析相结合,允许了蛋白质热稳定性的全局变化解析,并助力了很多内源相互作用的发现。然而,标准的TPP流程依赖于通过多个通道、多个温度点的定量结果拟合求算溶解温度变化(ΔTm),容易因采样不足而遗漏低丰度蛋白或低化学计量的修饰;此外,这种逐个定量也使得整个TPP流程在操作上较为复杂。首先,为了能够对低丰度糖基化修饰影响的蛋白质稳定性进行研究,团队针对传统热蛋白质组学方法(TPP)在灵敏度和通量方面进行了全面提升。该课题组通过理论计算将整个流程精简为两个关键温度区间(37–41°C与47–63°C),提出新的热稳定性参数Rm,仅通过两标定量试剂TMT的标记即可完成。模型数据验证显示,Rm与传统Tm高度相关,并在检测代谢物NADPH和药物panobinostat作用下的蛋白稳定性变化中表现出更高的灵敏度和一致性,且将检测通量提升了5倍。在此基础上,作者进一步将其与N-糖基化蛋白质富集技术相结合开发了GTSP方法,分别计算全蛋白质组与N-糖修饰肽段的Rm值差异,从而判断特定位点的糖基化是否对蛋白质热稳定性产生显著影响。