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Deciphering the RNA Landscapes on Mammalian Cell Surfaces.

2026-04-13 10:09 系统

论文题目:Deciphering the RNA Landscapes on Mammalian Cell Surfaces.

期刊名称:Protein & Cell

成果所有人:胡璐璐

论文发表时间:20250918

致谢平台或仪器:未提供

优秀案例分享:

我们提出一套统一的技术工具,用于在完整活细胞上对表面RNA进行全面分析、成像与定量。我们开发了AMOUR (in-situ amplification of outer membrane surface RNA)技术,这是一种基于T7的线性扩增方法,可在不破坏质膜的前提下准确描绘表面RNA图谱。我们同时建立了Intact‑Surface‑FISH(活细胞完整表面原位杂交),利用荧光DNA探针对活体原代细胞上的目标表面RNA进行标记。结合超分辨显微成像与流式细胞术,Intact‑Surface‑FISH能够在活细胞中稳健地可视化并定量代表性表面RNA。应用AMOUR,我们绘制了多种细胞类型细胞膜外表面RNA的景观图谱,发现人类与小鼠免疫细胞表面存在丰富的非编码RNA种类。利用Intact‑Surface‑FISH,我们在培养的HeLa细胞和人脐带血单个核细胞(hUCB‑MNCs)中确认了多种表面RNA的膜锚定并量化其丰度。成像与流式联合验证了Y家族RNA、剪接体snRNA U5、线粒体rRNA MTRNR2、线粒体tRNA MT‑TAVTRNA1‑1以及长链非编码RNA XIST的膜定位。三维纳米尺度超高分辨率成像进一步在活体hUCB‑MNCs中佐证了RNY5MTRNR2XIST的表面定位(图2)。相关文章发表于Protein & Cell.