论文题目：Integrative Proteomic Profiling of Tumor and Plasma Extracellular Vesicles Identifies a Diagnostic Biomarker Panel for Colorectal Cancer

期刊名称：Cell Reports Medicine

成果所有人：陆豪杰课题组

论文发表时间：2025年05月20日

致谢平台或仪器：Orbitrap Exploris 480、TIMS TOF Pro

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本研究针对结直肠癌（CRC）早期诊断中无创、高灵敏度生物标志物匮乏的临床挑战，开展了系统的整合性蛋白质组学研究。研究聚焦于肿瘤微环境与循环系统间的重要信使——细胞外囊泡（EV），通过平行表征结直肠癌组织来源的EV（t-EV）与匹配患者血浆来源的EV（p-EV）的蛋白质图谱，旨在发现高特异性的诊断标志物。在技术层面，本研究采用超速离心法分离纯化EV，并经由透射电镜、纳米颗粒追踪分析和Western blot进行表征验证。其后，运用基于液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）的高通量蛋白质组学技术对EV蛋白进行深度解析。仪器平台方面，关键的质谱分析Orbitrap Exploris 480上完成，该仪器以其高灵敏度、高分辨率和快速扫描速率，保障了对复杂EV样本中低丰度蛋白的精准鉴定与定量。色谱分离则依托于EASY-nLC 1200纳升液相系统（Thermo Fisher Scientific）。通过对CRC与健康对照样本的系统比较，本研究成功鉴定出t-EV与p-EV中共同显著失调的蛋白质谱。进一步通过生物信息学筛选及独立队列验证，本研究最终构建了一个由三种蛋白（包括CTTN、HNRNPK和PSMC6）组成的诊断标志物组合。该组合在训练集与验证集中均展现出卓越的诊断效能，其曲线下面积（AUC）显著高于传统血清标志物癌胚抗原，实现了从组织发现到液体活检验证的转化闭环。本研究不仅为结直肠癌的无创早期诊断提供了具有高潜力的新型工具，也确立了整合组织与体液EV蛋白质组学的策略在发现循环生物标志物方面的强大价值。