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论文题目:Uli-epic: profiling RNA modifications from ultra-low input samples.
期刊名称:Genome Biology
成果所有人:胡璐璐
论文发表时间:2025年11月
致谢平台或仪器:未提供
优秀案例分享:
我们开发了一种新型的文库构建策略——Uli-epic,该策略结合化学基础的RNA修饰检测技术,可在超低量RNA材料中检测表观转录组修饰。Uli-epic BID-seq将Uli-epic与BID-seq相结合,能够在单核苷酸分辨率下精确量化Ψ修饰,同时将检测限从10 ng的mRNA降低至100 pg。类似地,Uli-epic GLORI结合了Uli-epic与GLORI技术,在单核苷酸分辨率下对m6A进行精确量化,将检测限从200 ng的mRNA降低至10 ng。利用Uli-epic BID-seq和Uli-epic GLORI,我们成功地在HEK 293T细胞、神经干细胞(NSCs)以及野生型(WT)和胎儿生长受限(FGR)小鼠的精子中,进行了Ψ和m6A修饰位点的低输入RNA分析,相关文章已经在Genome Biology杂志在线发表。相关方法的专利已经进入实审阶段(专利号:202410438041.2)