根据蛋白序列，可使用多种已发表的高水平文献的软件算法，实现批量基于蛋白结构的预测，包括：

蛋白蛋白相互作用

蛋白-核酸相互作用

蛋白小肽（可设计小肽）

涉及软件，包括：

MegaDock: Bioinformatics, 2014

HDock: Nucleic Acids Research, 2017

AlphaFold-Multimer: Nature, 2021

RFdiffusion: Nature, 2023

RAPiDock: Nature Machine Intelligence, 2025

单次数据项目分析：3000元/次