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  • 刘杭
    刘杭
    职称:中级工程师

开展的服务:蛋白质组学样品前处理

可服务的新技术新方法:糖肽富集、快速微量蛋白质酶解

案例:

案例1202410月。脑科学研究院陈明课题组与我院张扬课题组合作小鼠脑损伤蛋白质组研究,服务一次。20例小鼠全脑组织的蛋白质组学鉴定项目,包括常规蛋白质组学差异分析,以及糖肽富集处理。经过特异性富集技术,富集到的糖肽,其鉴定率达到90%

案例22023~2025年,脑科学研究院黄芳课题组,服务六次。各种处理后的小鼠脑组织样本的label-free蛋白质组差异比较分析。鉴定蛋白数6500±211,蛋白定量率均超过85%

案例3202511月,阮承超课题组20例血浆样本的定量质谱鉴定前处理,无需去除高丰度蛋白的溶液酶解技术,助力精准定量。

代表论文:

[1] Jin Xiao; Hang Liu; Jun Yao; et al. The characterization ofserum proteomics and metabolomics across the cancer trajectory in chronic hepatitis B‐related liver diseases, VIEW, 2024, 5(6) (期刊论文) ( 本人标注: 共同第一作者 )

[2] Wang Ze-ning; Yao Jun; Liu, Hang; et al. oppHeatmap:Rendering Various Types of Heatmaps for Omics Data, APPLIED BIOCHEMISTRY AND BIOTECHNOLOGY, 2024,196(4): 2356-2366(期刊论文)

[3] 刘杭; 姚鋆; 杨芃原; 张扬 ; 糖蛋白质组学的信息学资源和方法, 生物化学与生物物理进展, 2016,43(9): 910-918 (期刊论文) ( 本人标注: 唯一第一作者 )

项目:

(1) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 32371334, 位点特异性的糖肽鉴定软件的升级与运用, 2024-01-01 2027-12-31, 50万元, 在研, 参与

(2) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 82271342, 丙酮酸羧化酶PC通过mTOR通路调控脑缺血-再灌注损伤的作用与机制研究, 2023-01-01 2026-12-31, 52万元, 在研, 参与

(3) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 82073113, TET2调控乳腺癌PD-L1基因转录的表观遗传学机制及其在抗肿瘤免疫中的作用, 2021-01-01 2024-12-31, 55万元, 资助期满, 参与

(4) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 82071707, PHB表观调控精母细胞线粒体代谢转换的作用机制研究, 2021-01-01 2024-12-31, 52万元, 资助期满, 参与

专著或者软件:

专利名称

软著登记号

授权日

发明人

项目负责人

MHC-I类新抗原预测系统[oppMHC-I]

2025SR1478418

20250807

刘杭

张扬

基于深度学习的MHC II型免疫抗原肽预测系统[oppMHC-II]

2025SR2044387

20251022

刘杭

张扬

所获奖励:

2023年和2024年度考核优秀