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技术团队
开展的服务:蛋白质组学样品前处理
可服务的新技术新方法:糖肽富集、快速微量蛋白质酶解
案例:
案例1、2024年10月。脑科学研究院陈明课题组与我院张扬课题组合作“小鼠脑损伤蛋白质组研究”,服务一次。20例小鼠全脑组织的蛋白质组学鉴定项目,包括常规蛋白质组学差异分析,以及糖肽富集处理。经过特异性富集技术,富集到的糖肽,其鉴定率达到90%。
案例2、2023年~2025年,脑科学研究院黄芳课题组,服务六次。各种处理后的小鼠脑组织样本的label-free蛋白质组差异比较分析。鉴定蛋白数6500±211,蛋白定量率均超过85%。
案例3、2025年11月,阮承超课题组20例血浆样本的定量质谱鉴定前处理,无需去除高丰度蛋白的溶液酶解技术,助力精准定量。
代表论文:
[1] Jin Xiao; Hang Liu; Jun Yao; et al. The characterization ofserum proteomics and metabolomics across the cancer trajectory in chronic hepatitis B‐related liver diseases, VIEW, 2024, 5(6) (期刊论文) ( 本人标注: 共同第一作者 )
[2] Wang Ze-ning; Yao Jun; Liu, Hang; et al. oppHeatmap:Rendering Various Types of Heatmaps for Omics Data, APPLIED BIOCHEMISTRY AND BIOTECHNOLOGY, 2024,196(4): 2356-2366(期刊论文)
[3] 刘杭; 姚鋆; 杨芃原; 张扬 ; 糖蛋白质组学的信息学资源和方法, 生物化学与生物物理进展, 2016,43(9): 910-918 (期刊论文) ( 本人标注: 唯一第一作者 )
项目:
(1) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 32371334, 位点特异性的糖肽鉴定软件的升级与运用, 2024-01-01 至 2027-12-31, 50万元, 在研, 参与
(2) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 82271342, 丙酮酸羧化酶PC通过mTOR通路调控脑缺血-再灌注损伤的作用与机制研究, 2023-01-01 至 2026-12-31, 52万元, 在研, 参与
(3) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 82073113, TET2调控乳腺癌PD-L1基因转录的表观遗传学机制及其在抗肿瘤免疫中的作用, 2021-01-01 至 2024-12-31, 55万元, 资助期满, 参与
(4) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 82071707, PHB表观调控精母细胞线粒体代谢转换的作用机制研究, 2021-01-01 至 2024-12-31, 52万元, 资助期满, 参与
专著或者软件:
专利名称 | 软著登记号 | 授权日 | 发明人 | 项目负责人 |
MHC-I类新抗原预测系统[oppMHC-I] | 2025SR1478418 | 20250807 | 刘杭 | 张扬 |
基于深度学习的MHC II型免疫抗原肽预测系统[oppMHC-II] | 2025SR2044387 | 20251022 | 刘杭 | 张扬 |
所获奖励:
2023年和2024年度考核优秀