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  • 沈枫林
    沈枫林
    职称:中级工程师

管理的仪器名称:Qtrap 7500Qtrap 6500

开展的服务:

1.  拟靶代谢物库的筛选

2. 二十种常见氨基酸定量检测

5. 糖代谢通路相关小分子检测

6. 多胺代谢通路相关小分子检测

7. 个性化定制的小分子方法优化及检测

8. 以及其他重要生物学通路相关小分子检测

可服务的新技术新方法:

1.常规蛋白组样品快速前处理

2.微量蛋白组样品前处理

3.整合的多组学样品快速前处理与检测 

案例:

一、个性化定制的小分子方法优化及检测

1. 完成乙酰辅酶A的色谱和质谱参数优化,并成功完成大样本检测,相关的数据支撑的研究成果发表于《Nature》: Cytosolic acetyl-coenzyme A is a signalling metabolite to control mitophagy. Nature, 10.1038/s41586-025-09745-x. Advance online publication.

2. 完成能量代谢相关小分子NMNNRNAD+等的色谱和质谱参数优化,并成功完成大样本检测,相关的数据支撑的研究成果发表于《Nature Cardiovascular Research》:Correcting mitochondrial loss mitigates NOTCH1-related aortopathy in mice. Nature cardiovascular research, 4(2), 235–247.

二、拟靶代谢组

完成拟靶库的构建与差异代谢物的筛选,包括四百多种代谢物与脂质,支撑的成果分别发表于《Journal of translational medicine》:roteomic and metabolomic analysis of platelet related samples reveals energy metabolism disorders in hepatocellular carcinoma, Journal of translational medicine, 2025;23(1):654.以及《Molecular oncology》:Targeted metabolomics reveals novel diagnostic biomarkers for colorectal cancer, Molecular oncology, 2025;19(6):1737-1750.

三、微量样品前处理蛋白组

1. 完成外泌体(蛋白量<1ug的前处理,5个样品总鉴定量>1500,平均鉴定量为700

2. 完成穿刺样本石蜡包埋切片的蛋白组前处理, 总鉴定量超过8000

3. 完成磁珠亲和富集微量蛋白(蛋白量<1ug的前处理6个样品平均鉴定量2441

代表论文:

1Fenglin Shen†, Yang Liu†, Xuelian Ruan†, Guoquan Yan, Lei Zhang, Jing Fang, Haojie Lu, Zuojian Hu*, Xinwen Zhou*; Integrated and ultrafast multiomics sample preparation workflow for screening biomarker panel of platelet biomolecules for early diagnosis of HCC, Analytical Chemistry, 2026; 98(11):8230-8241. IF6.7, 第一作者)

(2) Xuelian Ruan, Zuojian Hu, Fenglin Shen, Yongling Chen, Ziqing Zhong, Guiyong Ou, Xing Luo, Xue Qin*, Huabing Wang*; Proteomic and metabolomic analysis of platelet related samples reveals energy metabolism disorders in hepatocellular carcinoma, Journal of translational medicine, 2025;23(1):654. (IF7.5共同第一作者 )

(3) Zuojian Hu; Fenglin Shen; Yang Liu; Ziqing Zhong; Yongling Chen; Zhiyuan Xia; Cuiju Mo; Hongxiu Yu* ; Targeted metabolomics reveals novel diagnostic biomarkers for colorectal cancer, Molecular oncology, 2025;19(6):1737-1750.  (IF4.5共同第一作者 )

(4) 沈枫林; 冯兆莹; 方静; 张磊; 刘晓慧*; 周新文* ; 基于质谱的单细胞分辨的空间蛋白质组学新技术研, 高等学校化学学报, 2024, 45(12) (IF0.6第一作者 )

(5) Fenglin Shen; Yueting Xiong; Lei Zhang; Hengchao LI; Huanhuan Zhao; Xiaohui Liu*; Pengyuan Yang* ; Rapid Sample Preparation Workflow for Serum Sample Analysis with Different Mass Spectrometry Acquisition Strategies, Analytical chemistry, 2021, 93(3): 1578-1585 (IF6.7第一作者 )

(6)沈枫林; 熊悦婷; 刘晓慧* ; 杨芃原 ; 基于质谱的蛋白质绝对定量研究策略和建议, 质谱学报, 2021,42(2): 101-117( 中文核心,第一作者 )

(7) Tianqi Gong, Lujie Yang, Fenglin Shen, Hao Chen, Ziyue Pan, Quanqing Zhang, Yan Jiang, Fan Zhong, Pengyuan Yang* , Yang Zhang* ; Molecules. 2021;26(15):4653. IF4.6共同第一作者 )

(8) Chen Lu; Fenglin Shen; Shuaibo Wang; Yuyang Wang; Juan Liu; Wen-Ju Bai* ; Xiqing Wang ; An Engineered Self-sufficient Biocatalyst Enables Scalable Production of Linear Alpha Olefins from Carboxylic Acids, ACS Catalysis, 2018, 8(7): 5794-5798 ( IF13.1共同第一作者)

项目:

(1) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 32271490, 糖链数据库非依赖的位点特异性糖化蛋白质组鉴定技术开发, 2023-01-01 2026-12-31, 在研, 参与

(2) 复旦大学,DXYQ2025020,面向多组学的高通量样品前处理自动化系统的研发,2026-01-012026-12-31,在研,课题负责人。

专利:

催化合成线性ɑ-烯烃生物催化剂OleT-BM3R的序列、制备方法及其应用,王喜庆;沈枫林;陆晨;王帅博;陈浩2021-10-22,中国,ZL201810391903.5

所获奖励:

2024年度校级优秀个人、2023年度校级优秀个人、2022年度校级优秀个人