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技术团队
管理的仪器名称:Qtrap 7500,Qtrap 6500
开展的服务:
1. 拟靶代谢物库的筛选
2. 二十种常见氨基酸定量检测
5. 糖代谢通路相关小分子检测
6. 多胺代谢通路相关小分子检测
7. 个性化定制的小分子方法优化及检测
8. 以及其他重要生物学通路相关小分子检测
可服务的新技术新方法:
1.常规蛋白组样品快速前处理
2.微量蛋白组样品前处理
3.整合的多组学样品快速前处理与检测
案例:
一、个性化定制的小分子方法优化及检测
1. 完成乙酰辅酶A的色谱和质谱参数优化,并成功完成大样本检测,相关的数据支撑的研究成果发表于《Nature》: Cytosolic acetyl-coenzyme A is a signalling metabolite to control mitophagy. Nature, 10.1038/s41586-025-09745-x. Advance online publication.
2. 完成能量代谢相关小分子NMN,NR,NAD+等的色谱和质谱参数优化,并成功完成大样本检测,相关的数据支撑的研究成果发表于《Nature Cardiovascular Research》:Correcting mitochondrial loss mitigates NOTCH1-related aortopathy in mice. Nature cardiovascular research, 4(2), 235–247.
二、拟靶代谢组
完成拟靶库的构建与差异代谢物的筛选,包括四百多种代谢物与脂质,支撑的成果分别发表于《Journal of translational medicine》:roteomic and metabolomic analysis of platelet related samples reveals energy metabolism disorders in hepatocellular carcinoma, Journal of translational medicine, 2025;23(1):654.以及《Molecular oncology》:Targeted metabolomics reveals novel diagnostic biomarkers for colorectal cancer, Molecular oncology, 2025;19(6):1737-1750.
三、微量样品前处理蛋白组
1. 完成外泌体(蛋白量<1ug)的前处理,5个样品总鉴定量>1500,平均鉴定量为700。
2. 完成穿刺样本石蜡包埋切片的蛋白组前处理, 总鉴定量超过8000。
3. 完成磁珠亲和富集微量蛋白(蛋白量<1ug的前处理),6个样品平均鉴定量2441。
代表论文:
(1)Fenglin Shen†, Yang Liu†, Xuelian Ruan†, Guoquan Yan, Lei Zhang, Jing Fang, Haojie Lu, Zuojian Hu*, Xinwen Zhou*; Integrated and ultrafast multiomics sample preparation workflow for screening biomarker panel of platelet biomolecules for early diagnosis of HCC, Analytical Chemistry, 2026; 98(11):8230-8241. (IF6.7, 第一作者)
(2) Xuelian Ruan†, Zuojian Hu†, Fenglin Shen†, Yongling Chen, Ziqing Zhong, Guiyong Ou, Xing Luo, Xue Qin*, Huabing Wang*; Proteomic and metabolomic analysis of platelet related samples reveals energy metabolism disorders in hepatocellular carcinoma, Journal of translational medicine, 2025;23(1):654. (IF7.5,共同第一作者 )
(3) Zuojian Hu†; Fenglin Shen†; Yang Liu†; Ziqing Zhong; Yongling Chen; Zhiyuan Xia; Cuiju Mo; Hongxiu Yu* ; Targeted metabolomics reveals novel diagnostic biomarkers for colorectal cancer, Molecular oncology, 2025;19(6):1737-1750. (IF4.5,共同第一作者 )
(4) 沈枫林†; 冯兆莹†; 方静; 张磊; 刘晓慧*; 周新文* ; 基于质谱的单细胞分辨的空间蛋白质组学新技术研究, 高等学校化学学报, 2024, 45(12) (IF0.6,第一作者 )
(5) Fenglin Shen; Yueting Xiong; Lei Zhang; Hengchao LI; Huanhuan Zhao; Xiaohui Liu*; Pengyuan Yang* ; Rapid Sample Preparation Workflow for Serum Sample Analysis with Different Mass Spectrometry Acquisition Strategies, Analytical chemistry, 2021, 93(3): 1578-1585 (IF6.7,第一作者 )
(6)沈枫林; 熊悦婷; 刘晓慧* ; 杨芃原* ; 基于质谱的蛋白质绝对定量研究策略和建议, 质谱学报, 2021,42(2): 101-117( 中文核心,第一作者 )
(7) Tianqi Gong†, Lujie Yang†, Fenglin Shen†, Hao Chen, Ziyue Pan, Quanqing Zhang, Yan Jiang, Fan Zhong, Pengyuan Yang* , Yang Zhang* ; Molecules. 2021;26(15):4653. IF4.6,共同第一作者 )
(8) Chen Lu†; Fenglin Shen†; Shuaibo Wang; Yuyang Wang; Juan Liu; Wen-Ju Bai* ; Xiqing Wang* ; An Engineered Self-sufficient Biocatalyst Enables Scalable Production of Linear Alpha Olefins from Carboxylic Acids, ACS Catalysis, 2018, 8(7): 5794-5798 ( IF13.1,共同第一作者)
项目:
(1) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 32271490, 糖链数据库非依赖的位点特异性糖化蛋白质组鉴定技术开发, 2023-01-01 至 2026-12-31, 在研, 参与
(2) 复旦大学,DXYQ2025020,面向多组学的高通量样品前处理自动化系统的研发,2026-01-01至2026-12-31,在研,课题负责人。
专利:
催化合成线性ɑ-烯烃生物催化剂OleT-BM3R的序列、制备方法及其应用,王喜庆;沈枫林;陆晨;王帅博;陈浩,2021-10-22,中国,ZL201810391903.5
所获奖励:
2024年度校级优秀个人、2023年度校级优秀个人、2022年度校级优秀个人