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技术团队
管理的仪器名称:基质辅助激光解析电离组织成像仪-rapifleX & 离子淌度质谱仪
开展的服务:单一蛋白鉴定,聚合物(蛋白、肽段)等分子量,肽段denovo分析,糖蛋白复合物分析(N-糖位点、N/O-完整糖肽分析、糖组学分析),大/小分子异构体解析。
可服务的新技术新方法:N-完整糖肽末端唾液酸异构体分析
案例:
①基于基质辅助激光激光解析质谱为分析手段,开发新型的膀胱癌无创诊断标志物,研究人员收集了来源于海军军医大学第一附属医院的尿液样本,包括来源于膀胱癌患者、泌尿系统良性疾病患者、泌尿系统其他恶性肿瘤患者和健康对照的队列,构建了目前BC糖基化研究中最大的临床队列(n=333)。随后,研究团队采用自主开发的高通量和高灵敏N-糖组技术对尿液EV的N-糖组特征进行鉴定 (每个样本仅需要1 mL尿液) 并从中筛选到一组具有显著差异的N-糖链,进一步采用机器学习技术构建诊断模型,在两个独立验证队列中进行了验证,其ROC AUC 值分别为 0.88 和 0.86,证明了其强大的诊断能力。此外,研究团队又分别针对膀胱细胞系及衍生EV、膀胱癌的癌与癌旁组织、FFPE组织切片等多种样本来源进行了N-糖组、N-糖蛋白质组、N-糖空间成像的多维度糖基化研究。尿液EV的糖蛋白质组分析表明:携带癌症相关糖特征的糖蛋白与机体内部的免疫活动密切相关。癌与癌旁组织的N-糖组分析表明:高甘露糖型N-糖在癌症区域显著上调。针对FFPE组织切片的N-糖空间原位分析则表明:N-聚糖的空间分布与组织变化相对应,N-聚糖空间聚类分析结果与不同组织类型的空间分布密切吻合。膀胱细胞系与衍生EV的配对分析则表明:二者的糖基化背景不同,这些差异可能反映了糖基化在EV的产生和分选过程中具有重要的作用。总而言之,本研究为开发基于细胞外囊泡的N-糖组无创诊断标志物建立了基础,并为进一步应用于其他不同疾病的尿液来源无创生物标志物的研究提供了新思路(Urinary extracellular vesicle N-glycomics identifies diagnostic glycosignatures for bladder cancer,2025,16:2292.)。
支撑我校国家重点研发计划(2021YFA0910600; 2023YFF1205900; 2024YFA1306300))等。数据发表文章,Int. J. Bio. Macro. 2024,268:131766.IF7.7), Nat. Comm., 2024, 15: 2997. (IF16.6), Anal. Chem. 2024, 96:7289−7296. (IF 6.8), Carbohyd Polym, 2024, 335:122084. (IF 10.7), Nat. Sci. Rev. 2024, 11: nwae341.(IF 16.3)。
②基于糖复合物平台建立的完整糖复合物的鉴定、定量与验证分析技术,针对不同生物样本如生物制药品、血液、血吸虫、线虫、不同细胞样本等进行了完整糖蛋白以及糖肽的修饰分析,累计服务时长约900小时。支撑我校(2021YFA0910600;国家重点研发计划项目(2021YFC2300800、2021YFC2300803),复旦大学附属儿科医院国家重大项目(2021YFC2700801),国自然重点项目(22434001)等,支撑发表文章 J. Am. Chem. Soc. 2024, 146: 20539−20543. (IF 14.5), Mol Cell Proteomics, 2024, 23: 100777. (IF 6.1), Anal. Chem. 2024, 96: 14448−14455. (IF 6.8), Nat. Comm., 2024, 15: 8055. (IF16.6), Carbohyd Polym, 2024, 335: 121499. (IF 10.7)。
代表论文:
[1] Zhouer Lu, Xiaoxiao Feng, Bin Fu, Xiaojin Mo, Ting Zhang, Liming Wei*, Zhonghua Li*, Haojie Lu. Serum IgG galactosylation as a potential biomarker for diagnosis of echinococcosis,Analyst, 2025, 150:2058.
[2] Xiaoxiao Feng, Jing Li, Chong Li, Jun Wang, Yuying Liang, Bin Fu, Zhenyu Sun, Jun Yao, Juan He, Aiying Nie, Liming Wei, Weiwei Feng, Haojie Lu. Siaquant unveils serum α2-3 α2-6 sialylation heterogeneities and predicts neoadjuvant chemotherapy, Anal.Chem.2025, 97:7682-7691.
[3] Liming Wei, Yuning Chen, Xiaoxiao Feng, Jun Yao, Lei Zhang, Xinwen Zhou, Guoquan Yan, Hong Qiu, Chunhe Wang, Haojie Lu. Elucidation of N-/O-glycosylation and site-specific mapping of sialic acid linkage isomers of SARS-CoV-2 human receptor angiotensin-converting enzyme 2. Analyst, 2023, 148: 5002-5011.
[4] Xiaoxiao Feng, BaiMaYangJin, Xiaojin Mo, Fangyan Zhang, Wei Hu, Zheng Feng, Ting Zhang, Liming Wei*, Haojie Lu*. IgG glycomic profiling identifies potential biomarkers for diagnosis of echinococcosis. J. Chromatography B., 2023, 1227: 123838.
[5] Xiaoxiao Feng#, Hong Shu#, Shu Zhang, Ye Peng, Lei Zhang, Xinyi Cao, Liming Wei*, Haojie Lu*. Relative quantification of N‑glycopeptide sialic acid linkage isomers by ion mobility mass spectrometry. Anal. Chem., 2021, 93:15617-15625.
[6] Ziqing Lin#, Liming Wei#, Wenxuan Cai, Wei Guo, Stephen Ford, Gary Diffee, Ying Ge*. Simultaneous quantification of protein expression and modifications by top-down targeted proteomics: a case of sarcomeric subproteome. Mol. Cell. Proteomics. 2019, 18(3):594-605
[7] Liming Wei#, Yi Wang#, Ling Lin, Lei Zhang, Yan Shi, Ping Xiang, Shujun Cao, Min Shen*, Pengyuan Yang*. Identification of potential serum biomarkers of acute paraquat poisoning in humans using an iTRAQ quantitative proteomic. RSC Advances, 2018, 8(19): 10598-10609.
[8] Liming Wei#, Zachery R. Gregorich#, Ziqing Lin, Wenxuan Cai, Yutong Jin, Susan H. McKiernan, Sean McIlwain, Judd M. Aiken, Richard L. Moss, Gary M. Diffee, Ying Ge*. Novel sarcopenia-related alterations in sarcomeric protein post-translational modifications in skeletal muscles identified by top-down proteomics. Mol. Cell. Proteomics., 2018, 17(1): 148-159.
[9] Guobin Xu, Wei Zhang, Liming Wei*, Haojie Lu, Pengyuan Yang*. Boronic acid-functionalized detonation nanodiamond for specific enrichment of glycopeptides in glycoproteome analysis. Analyst, 2013, 138 (6): 1876 -1885.
[10] Guobin Xu, Xiaoyi Chen, Jianhua Hu, Pengyuan Yang, Dong Yang*, Liming Wei*. Immobilization of trypsin on graphene oxide for microwave-assisted on-plate proteolysis combined with MALDI-MS analysis. Analyst, 2012, 137(12): 2757-2761.
项目:
国家卫生健康委包虫病防治研究重点实验室开放课题(2020)
上海市浦江人才(2018)
上海市法医学重点实验室开放课题(2014)
国家自然科学基金青年科学基金项目(2013)
专利:
[1]魏黎明,封晓晓,陆豪杰,“用于肝棘球蚴病鉴别的标志物、产品及系统”,2022-12-09,申请专利号:CN202211167213.4
[2]魏黎明,封晓晓,陆豪杰,“肝棘球蚴病诊断标志物血液免疫球蛋白G唾液酸及产品”,2025-4-25,专利号:ZL202211105567.6
[3]魏黎明,封晓晓,陆豪杰,“N-糖肽末端唾液酸α2.6和α2.3连接异构相对定量方法”,2022-05-20,专利号:ZL202110615619.3
[4]魏黎明,封晓晓,陆豪杰,“区分肝癌和正常人的末端唾液酸化异构糖肽标志物及其筛查方法”,2022-08-19,专利号: ZL202110666414.8
[5]魏黎明,徐国宾,张伟,陆豪杰,杨芃原,“表面修饰氨基苯硼酸的纳米碳材料及其制备方法和应用”2012-12-26,专利号:CN201210573541.4
[6]李宏,魏黎明,杨芃原,方盼,“一种定量检测肽段糖基化水平的方法”,2014-06-20,专利号:CN201410280757.0
专著或者软件:
Pengyuan Yang*, Liming Wei*. Novel Nanomaterials for Biomedical, Environmental and Energy Applications. 2019, ISBN: 978-0-12-814497-8, 37-73.
所获奖励:
上海市进出口检验检疫总局颁发的科技兴检奖(一等奖)(2009)
上海研发公共服务平台“服务标兵”(2014)