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  • 周新文
    周新文
    职称:高级工程师

管理的仪器名称:单细胞蛋白质组质谱分析系统、精准蛋白质组学仪

开展的服务:蛋白质组学方向相关技术服务

可服务的新技术新方法:

1) 蛋白相互作用质谱鉴定。包括抗体-抗原相互作用后直接洗脱或SDS-Page快速短距分离后进行酶解,鉴定相互作用蛋白。

2) 单细胞、少量细胞(单细胞至10000个细胞)、微量组织(0.1立方毫米体积或石蜡、冰冻切片)的蛋白组学的深度覆盖研究。

3) 稳定同位素标记或非标记的,磷酸化蛋白组学定性定量分析。

4) 细胞、组织的内源性多肽组学的定性定量分析。

5) 多肽序列分析,二硫键定位分析。

案例:

1.服务案例:上海医学院公共技术平台的精准蛋白质组学仪可以对蛋白质、多肽、多糖、核算序列、等进行高精度和高准度的定性工作。成都圣诺生物制药有限公司是一家拥有多肽合成和修饰核心技术的高新技术企业,具有先进、高效的多肽药物工艺研发和规模化生产能力。双方合作在2024年开发了2种针对多肽药物的氨基酸序列及二硫键定位的方法,一种是化学裂解法,针对不具备酶切位点的含有多对二硫键的多肽药物,另外一种方法是直接酶切法,根据多肽的的氨基酸序列的特征,设计特异性的酶切方法,将不同的二硫键归属到不同的酶切肽段中。基于以上开发的方法,双方在2024年共计完成了5个项目的合作,完成了16次多肽药物的检测,为平台产生共享收入42000元,为成都圣诺生物制药有限公司多肽药物的研发、生产、项目申报提供了支持,预期为公司产生经济效益达500万元。

2. 维修案例:20255月底,上海医学院公共技术平台质谱技术平台工程师发现Easynano1200(与大型质谱仪联合使用)出现故障,经排查,是其B流动相六通阀无法切阀,B泵密封圈也有漏液现象,无法完成样品的上样及洗脱。周新文、赵欢欢两名工程师按照仪器操作指导书将色谱中暂时用不到的废液阀与B阀交换位置重新安装,并给B泵更换了新的密封圈,历经三天,仪器六通阀正常工作且B泵测漏顺利通过,节省了上门维护费和硬件更换费用8万元。

代表论文:

1) Optimized MALDI-TOF MS Strategy for Characterizing Polymers. Frontiers in Chemistry. 通讯作者。

2) Phenylalanine Impairs Insulin Signaling and Inhibits Glucose Uptake Through Modification of IRβ.Nature Communications. 参与发表。

3) pGlycoQuant with a deep residual network for quantitative glycoproteomics at intact glycopeptide level.Nature Communications. 参与发表。

项目:

1.2022年度复旦大学医工结合项目(一般项目);

2.上海市2022年度“科技创新行动计划”科学仪器领域项目:“仪器共享配套操作与应用技术研究”;

3.上海市2023年度上海市公共研发平台的能力提升项目

所获奖励:获得复旦大学2023年度大型科研仪器使用先进个人

获得2014年度“上海研发公共服务平台服务标兵”